Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms