Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps4xP62702 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps4xP62702 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 442.3 ms