Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms