Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23bP54728 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms