Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms