Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms