Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic1P46684 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zic1P46684 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms