Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms