Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx2P43241 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms