Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms