Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms