Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6fP35460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms