Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms