Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms