Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms