Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VtnP29788 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms