Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprmP28828 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23■■□□□ 1.27
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