Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RxraP28700 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms