Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BgnP28653 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BgnP28653 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms