Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa5P28312 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms