Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms