Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms