Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U2af2P26369 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U2af2P26369 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms