Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CftrP26361 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CftrP26361 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CftrP26361 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CftrP26361 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CftrP26361 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms