Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms