Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd247P24161 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms