Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms