Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms