Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a2P20490 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms