Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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