Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VimP20152 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VimP20152 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VimP20152 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VimP20152 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms