Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd1P19182 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms