Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms