Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpraP18052 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms