Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Defa-rs1P17533 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Defa-rs1P17533 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Defa-rs1P17533 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Defa-rs1P17533 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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