Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabra6P16305 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabra6P16305 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gabra6P16305 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gabra6P16305 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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