Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptbP15508 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SptbP15508 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptbP15508 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SptbP15508 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms