Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srp54P14576 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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