Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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