Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms