Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms