Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf2P09926 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms