Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb1P09055 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms