Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmcP08882 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms