Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a2P08122 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a2P08122 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a2P08122 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a2P08122 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a2P08122 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a2P08122 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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