Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01673 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01673 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01673 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01673 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms