Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01670 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01670 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01670 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01670 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01670 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01670 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms