Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01649 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01649 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01649 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01649 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms