Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01641 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01641 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01641 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01641 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01641 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01641 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms