Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cd160O88875 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd160O88875 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms